如果女方怀孕起诉离婚男方不同意，法院一般会综合具体情况进行判决。

在女方怀孕时起诉离婚且男方不同意的情况下，法院通常会慎重处理。首先，需要明确的是，女方在怀孕期间是有权提出离婚诉讼的。法院在审理此类案件时，会全面考虑各种因素。一方面，会关注女方提出离婚的原因和具体情况，比如是否存在男方的重大过错，如家暴、出轨等，或者双方感情确实已经破裂无法挽回。另一方面，也会考虑到女方怀孕的特殊状况以及未来孩子的权益。

如果男方坚决不同意离婚，法院会审查双方之间是否还有修复感情的可能。可能会进行调解，尝试促使双方解决矛盾，修复关系。但如果女方坚持离婚，且能提供充分的证据证明夫妻感情确已破裂，法院也可能会判决离婚。同时，对于财产分割和子女抚养等问题，也会依据相关法律规定进行处理。在财产分割方面，会遵循公平合理的原则，考虑双方的贡献、实际情况等因素。对于子女抚养，由于孩子尚未出生，一般会在孩子出生后再行确定具体的抚养安排。

总之，这种情况下的处理较为复杂，法院会依据法律和具体情况作出公正的判决。双方都应该理性对待，尊重法律和法院的裁决。

《中华人民共和国民法典》 第一千零七十九条

夫妻一方要求离婚的，可以由有关组织进行调解或者直接向人民法院提起离婚诉讼。

人民法院审理离婚案件，应当进行调解；如果感情确已破裂，调解无效的，应当准予离婚。

有下列情形之一，调解无效的，应当准予离婚：

（一）重婚或者与他人同居；

（二）实施家庭暴力或者虐待、遗弃家庭成员；

（三）有赌博、吸毒等恶习屡教不改；

（四）因感情不和分居满二年；

（五）其他导致夫妻感情破裂的情形。

一方被宣告失踪，另一方提起离婚诉讼的，应当准予离婚。