妻子可以通过向法院提起诉讼的方式申请离婚。

当丈夫失踪多年，妻子若要申请离婚，可以采取以下步骤。首先，妻子需要确定丈夫失踪的时间达到了法律规定的期限。一般来说，宣告失踪需要下落不明满两年，宣告死亡则需要下落不明满四年或因意外事故下落不明满两年。在满足相应条件后，妻子可以向法院申请宣告丈夫失踪或死亡。

如果申请宣告失踪成功，妻子可以向法院提起离婚诉讼。法院会根据实际情况进行审理和判决。在审理过程中，法院会综合考虑各种因素，如夫妻感情是否确已破裂、子女抚养问题、财产分割等。由于丈夫处于失踪状态，可能在送达等程序上会有一些特殊处理。

如果妻子申请宣告死亡，那么自宣告死亡判决生效之日起，婚姻关系自动解除。但需要注意的是，如果丈夫后来重新出现，经本人或利害关系人申请，法院应当撤销死亡宣告。此时，原婚姻关系并不当然恢复，需要双方协商或通过法律程序来确定。

在整个过程中，妻子需要准备相关的证据材料，如证明丈夫失踪时间和情况的证据等。同时，建议妻子寻求专业律师的帮助，律师可以根据具体情况提供专业的法律建议和指导，帮助妻子顺利完成离婚程序。离婚是一个较为复杂的法律程序，尤其是在涉及到一方失踪的情况下，更需要谨慎处理，以保障自己的合法权益。

《中华人民共和国民法典》 第一千零七十九条

夫妻一方要求离婚的，可以由有关组织进行调解或者直接向人民法院提起离婚诉讼。

人民法院审理离婚案件，应当进行调解；如果感情确已破裂，调解无效的，应当准予离婚。

有下列情形之一，调解无效的，应当准予离婚：

（一）重婚或者与他人同居；

（二）实施家庭暴力或者虐待、遗弃家庭成员；

（三）有赌博、吸毒等恶习屡教不改；

（四）因感情不和分居满二年；

（五）其他导致夫妻感情破裂的情形。

一方被宣告失踪，另一方提起离婚诉讼的，应当准予离婚。

经人民法院判决不准离婚后，双方又分居满一年，一方再次提起离婚诉讼的，应当准予离婚。