当借款人失踪时，可以通过向法院提起诉讼来维护自身权益。需要准备相关证据、确定管辖法院等。

借款人失踪后起诉是一种法律救济途径。首先要明确的是，即使借款人失踪，也不影响起诉。在起诉前，要尽可能收集和整理与借款相关的证据，如借条、转账记录、聊天记录、证人证言等，这些证据将对案件的审理起到关键作用。

接下来，要确定管辖法院。一般来说，根据民事诉讼法的规定，可以选择被告住所地或者合同履行地的法院。如果有约定管辖法院，且该约定不违反法律规定，则按照约定执行。

然后，撰写起诉状，明确诉讼请求和事实理由。在起诉状中，要详细阐述借款的事实经过、金额、还款期限等情况。

向法院提交起诉状和相关证据，缴纳诉讼费用。法院受理案件后，会按照法定程序进行送达。如果借款人下落不明，法院可能会采取公告送达的方式。

在庭审中，要充分阐述自己的观点和证据，进行举证和质证。法院会根据事实和法律进行审理和判决。

即使借款人失踪，法院作出判决后，如果借款人有可供执行的财产，可以通过执行程序来实现债权。

总之，借款人失踪后起诉需要遵循一定的法律程序和要求，同时要注意证据的收集和整理，以保障自己的合法权益。

《中华人民共和国民法典》 第四十二条

失踪人的财产由其配偶、成年子女、父母或者其他愿意担任财产代管人的人代管。

代管有争议，没有前款规定的人，或者前款规定的人无代管能力的，由人民法院指定的人代管。

《中华人民共和国民法典》 第四十三条

财产代管人应当妥善管理失踪人的财产，维护其财产权益。

失踪人所欠税款、债务和应付的其他费用，由财产代管人从失踪人的财产中支付。

财产代管人因故意或者重大过失造成失踪人财产损失的，应当承担赔偿责任。