如果欠款已经还了但欠条丢了，可以通过多种方式来保障自身权益，比如要求对方出具收条、保存好还款的证据等。

当遇到欠款已经偿还但欠条丢失的情况时，不必过于惊慌。首先，应尽可能找到其他能够证明还款事实的证据，例如银行转账记录、现金收条、证人证言、聊天记录或通话录音等。这些证据可以在日后可能出现的纠纷中起到关键作用。

与对方进行沟通也是很重要的一步。可以诚恳地向对方说明欠条丢失的情况，并请求对方出具一份书面的收条，明确表示已经收到了还款。在收条中应详细说明还款的金额、时间、方式等重要信息，以确保其法律效力。

同时，要妥善保存好所有与还款相关的证据，包括还款的凭证、与对方的沟通记录等。如果对方日后否认收到还款，这些证据可以作为有力的反驳。

此外，还可以考虑通过公证的方式来固定还款的事实。公证机构可以对还款的过程和相关证据进行公证，增强其可信度和证明力。

需要注意的是，在处理这种情况时，要保持冷静和理性，避免与对方产生不必要的冲突。如果确实存在纠纷，可以通过协商、调解或诉讼等方式来解决。在整个过程中，要充分利用法律手段来维护自己的合法权益。

总之，欠款还了但欠条丢了虽然可能会带来一些麻烦，但通过采取上述措施，可以有效地降低风险，保障自身权益。

《最高人民法院关于审理民间借贷案件适用法律若干问题的规定》 第二条

出借人向人民法院提起民间借贷诉讼时，应当提供借据、收据、欠条等债权凭证以及其他能够证明借贷法律关系存在的证据。

当事人持有的借据、收据、欠条等债权凭证没有载明债权人，持有债权凭证的当事人提起民间借贷诉讼的，人民法院应予受理。被告对原告的债权人资格提出有事实依据的抗辩，人民法院经审查认为原告不具有债权人资格的，裁定驳回起诉。