预抵押登记和抵押登记主要在适用阶段、法律效力等方面存在区别。

预抵押登记是在商品房预售中，购房人在支付首期规定的房价款后，贷款银行代其支付其余的购房款，将所购商品房抵押给贷款银行作为偿还贷款履行担保的行为。而抵押登记则是在债务关系明确后，将特定的财产进行抵押并办理登记手续。

在适用阶段上，预抵押登记通常发生在购房过程中，房屋尚未建成或尚未办理产权证书；抵押登记则多在房屋已经建成且产权明确的情况下进行。

法律效力方面，预抵押登记更多的是一种临时性的保障措施，虽然具有一定的效力，但在最终实现抵押权时可能存在一些不确定性；抵押登记的效力相对更为确定和稳固。

从保障程度来看，预抵押登记对于银行等抵押权人来说，在一定程度上降低了风险，但不如抵押登记那么直接和可靠；抵押登记能更明确地保障债权人的权益。

在实际操作中，预抵押登记可能会随着房屋建设和产权办理的进展而转化为正式的抵押登记。同时，无论是预抵押登记还是抵押登记，都需要遵循相关的法律法规和登记程序，以确保各方的合法权益得到保障。

总之，预抵押登记和抵押登记在多个方面存在差异，当事人在涉及相关业务时应充分了解其特点和意义，根据具体情况做出合理的选择和安排。

《中华人民共和国民法典》 第三百九十四条

为担保债务的履行，债务人或者第三人不转移财产的占有，将该财产抵押给债权人的，债务人不履行到期债务或者发生当事人约定的实现抵押权的情形，债权人有权就该财产优先受偿。

前款规定的债务人或者第三人为抵押人，债权人为抵押权人，提供担保的财产为抵押财产。

《中华人民共和国民法典》 第四百零二条

以本法第三百九十五条第一款第一项至第三项规定的财产或者第五项规定的正在建造的建筑物抵押的，应当办理抵押登记。抵押权自登记时设立。