法院对于有两个小孩的离婚案件，判决抚养权归属时通常会综合考虑多方面因素，以子女的最佳利益为出发点，可能会判决一人抚养一个孩子，也可能将两个孩子的抚养权都判给一方。

在处理有两个小孩的离婚抚养权问题时，法院会进行全面、细致的考量。首先会尊重父母双方的意愿，如果父母能够协商一致并达成合理的抚养安排，法院通常会予以认可。如果父母无法达成一致，法院则会重点审查以下因素。

孩子的年龄和意愿是重要因素之一。对于年幼的孩子，尤其是哺乳期内的婴儿，一般会倾向于判给母亲抚养。但随着孩子年龄增长，其意愿也会被重视。

父母的抚养能力和条件也会被评估。包括经济状况、居住环境、教育资源、时间精力等。哪一方更能为孩子提供稳定、良好的成长环境和条件，就更有可能获得抚养权。

孩子与父母的感情和生活依赖程度也会影响判决。如果孩子长期与某一方生活且感情深厚，可能会倾向于该方抚养。

此外，父母的品德、行为习惯等也会在考虑范围内。法院会尽力确保判决结果有利于孩子的身心健康和全面发展。

需要强调的是，每个案件都是独特的，法院会根据具体情况进行具体分析和判断，以实现对孩子权益的最佳保护。无论抚养权如何判决，父母双方都应继续承担抚养和教育孩子的责任，为孩子的成长提供关爱和支持。

《中华人民共和国民法典》 第一千零八十四条

父母与子女间的关系，不因父母离婚而消除。离婚后，子女无论由父或者母直接抚养，仍是父母双方的子女。

离婚后，父母对于子女仍有抚养、教育、保护的权利和义务。

离婚后，不满两周岁的子女，以由母亲直接抚养为原则。已满两周岁的子女，父母双方对抚养问题协议不成的，由人民法院根据双方的具体情况，按照最有利于未成年子女的原则判决。子女已满八周岁的，应当尊重其真实意愿。